Viljandi 5. Keskkool
Hoone valmis ning kool asutati 1965. aastal. Varem on kool kandnud Viljandi Internaatkooli nime (põhikool 1973. aasta 1. septembrini). Viljandi 5. Keskkooli nime sai kool 1.septembril 1973. Samal aastal avati siin vene keele ja kirjanduse süva- õppega klassid, 1975. aastal ka muusikaklass. Aastaid tegutses koolis Rahvaste Sõpruse Klubi Vikerkaar.
Viljandi Paalalinna Gümnaasium (1995-2012)
Kool hakkas kandma nime Viljandi Paalalinna Gümnaasium 28. juunist 1995. Gümnaasiumis sai valida humanitaar-, reaal- või majandusharu vahel. Saksa keele õppijatel oli 12. klassis võimalus sooritada Saksamaa Liitvabariigi Kultuuriministrite Alatise Kogu II astme keeleeksam.
Viljandi Paalalinna Kool (2012- )
2012. aastal sai koolist põhikool ning nimeks Viljandi Paalalinna Kool. Põhikoolis õpitakse süvendatult saksa ja inglise keelt.